Iori Kitahara pindah ke kota pesisir Izu untuk tahun pertamanya di universitas tersebut, tinggal di atas Grand Blue, toko selam milik pamannya. Iori memiliki harapan dan impian yang tinggi untuk mendapatkan pengalaman kuliah yang ideal, tetapi ketika ia memasuki toko tersebut, ia terhanyut dalam aktivitas alkoholik para anggota Klub Selam yang riang yang sering mengunjungi tempat itu. Dibujuk oleh kakak kelasnya, Shinji Tokita dan Ryuujirou Kotobuki, Iori dengan enggan bergabung dengan pesta aneh mereka. Sepupunya, Chisa Kotegawa, kemudian masuk dan memergokinya, membuat Iori sangat dibenci.
Diadaptasi dari manga komedi populer karya Kenji Inoue dan Kimitake Yoshioka, Grand Blue mengikuti petualangan Iori bersama teman-teman barunya yang eksentrik saat ia berusaha mewujudkan impian kuliahnya yang ideal, sambil juga belajar cara menyelam.
